Ducati 959 Panigale Special Edition chính thức trình làng giá 20,000$. So với phiên bản tiêu chuẩn, 959 Panigale Special Edition khác biệt lớn nhất ở việc trang bị ống xả hàng hiệu Akrapovic đặt dưới gầm xe. Dàn nhựa bên ngoài cũng được sửa đổi để phù hợp với hệ thống ống xả mới. Xe sử dụng rất nhiều trang bị làm từ hợp kim nhôm, như nắp bình xăng, tay phanh/côn hay chống gãy tay phanh/côn.